美しい真珠をうむ”アコヤガイ”の進化に気候変動が影響!?

アコヤガイは、真珠の養殖に利用される真珠の母貝です。貝殻の内側に異物が混入すると、その異物を核として真珠層を巻く性質があり、真珠の養殖に使用されています。日本では19世紀後半から真珠養殖が盛んに行われ、美しい真珠を広く養殖・商品化できるようになりました。

これまで、このアコヤガイについて、遺伝学的、進化論的な観点では、ほとんど理解されてきませんでした。2012年、沖縄科学技術大学院大学（OIST）マリンゲノミックスユニットの研究者らは、そんなアコヤガイのゲノムを解読することに成功しました。そしてこの度、OISTの研究者らが、国立研究開発法人水産研究・教育機構増養殖研究所、三重県農林水産部と共同で、このゲノム情報に基づいてさらに研究を進めました。

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いかにして日本本島に移動したか

彼らは西太平洋のいたるところで採集したアコヤガイのゲノムの塩基配列データを用い、各地の個体群が遺伝的および地理的にどのように異なるかについて、分析しました。その結果、アコヤガイが時間の経過に伴って起こった環境変化に対し、どのように適応してきたのかを洞察することができました。

「アコヤガイの集団構造を理解し、沖縄も属する南西太平洋からどのようにして日本本島に移動したのかを理解することが主な目的でした。アコヤガイは西太平洋に広く分布しているので、遺伝的分化を理解するには良いモデル生物なのです。」と、Evolutionary Applications誌に発表された研究論文の筆頭著者である竹内猛博士は説明します。

地域による遺伝的差異の謎にせまる

アコヤガイを使った日本の真珠生産は、一世紀にわたって成功を収めましたが、その後、赤潮の頻発と感染症の拡大が打撃となり、1990年台には生産が激減しました。さらにこの時期、中国産アコヤガイが日本の真珠養殖水域に導入されたことから、アコヤガイ個体群の遺伝的多様性が失われることが懸念されました。

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アコヤガイをよりよく理解し保護するために、研究者らは日本本島、沖縄近辺を含む南西諸島南部、中国、ミャンマー、カンボジアの各地から採取した約200個体の標本を分析しました。近年における日本のアコヤガイ集団と中国のアコヤガイ集団の混合による影響を最小限に抑えるため、分析には2000年から2003年に採取した凍結標本を用いました。

この研究の中心となったOISTマリンゲノミックスユニットの竹内博士らは、個体群の分布としては北部に当たる日本本島のアコヤガイと、南部にあたる南西諸島、中国、カンボジアの個体群とは、遺伝的に離れていることを発見しました。しかし、陸地による障壁で隔てられているわけではない日本本島と南西諸島のアコヤガイが、なぜ遺伝的に異なるのかが大きな謎でした。黒潮の強い海流により、アコヤガイは南西諸島から本島に容易に移動でき、個体群は混ざり合うことが想定されるからです。

※写真は西太平洋にあるアコヤガイ個体群の分布。
(A) 採取地域は、JPN：本州、四国、九州を含む日本本土、NAN：南西諸島、CHN：中国、KHM：カンボジア、MMR：ミャンマー。　
(B) 全ゲノムSNPデータを用いたPCA（主成分分析）では、北部集団（日本本島）が南部集団（カンボジア、中国、南西諸島）から遺伝的に分岐したことが明らかになった。インド洋ミャンマーにおける個体群は、地理的障壁のため太平洋のその他の個体群と識別可能。さらに日本の鹿児島県上甑島の個体群は、砂州により海から隔離されたラグーン(潟湖)に生息するため、遺伝的に特有である。

この謎を解くため、研究者らは、海面水温や海水中の酸素、二酸化炭素、リン酸塩、硝酸塩、塩分濃度といったさまざまな環境要因と遺伝的多様性との関連を調べました。統計解析の結果、海面水温と酸素濃度が遺伝的変異に強く関係していることがわかりました。日本本島と南西諸島の個体群との間の遺伝的差異は、各地域の環境条件への適応と関係がある可能性が示されたのです。

貴重な遺伝資源を保全するために

約2万年前の最終氷期極大期、海洋表面温度は現在よりかなり低く、日本のアコヤガイの個体群は日本本島に存在しませんでした。しかし最終氷期以降、日本の気温は上昇し、6,000年前、現在よりも２度から３度高くなってピークに達し、アコヤガイの分布は日本本島へと北上しました。

将来の気候変動と海水温上昇がアコヤガイの分布に影響する可能性があるため、研究者たちは今後もアコヤガイの遺伝子研究をさらに続けていきたいと考えています。

「今回の研究では、全ゲノム情報を用いて西太平洋のアコヤガイの遺伝学的な集団構造を明らかにしました。現在は、日本のアコヤガイの個体群を他の地域の個体群と識別するためのDNAマーカーを開発しており、今後、日本のアコヤガイに固有の遺伝資源の保全に役立つと思います。」と竹内博士は語っています。

※詳細はこちら
https://www.oist.jp/ja/node/34570/
（OIST公式サイト内「気候変動と海水温上昇が真珠貝の進化に影響」）